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【科技日報】高質(zhì)量參考基因組揭示菟絲子寄生習性演化

文章來源:科技日報  |  發(fā)布時間:2018-07-12  |  作者:趙漢斌  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  科技日報昆明7月11日電 (記者趙漢斌)寄生植物獨特的起源、演化和特殊生理生態(tài)長期以來吸引著眾多研究者的目光。中國科學院昆明植物研究所研究人員以南方菟絲子為對象,通過全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序,最新獲得了首個寄生植物高質(zhì)量參考基因組。研究結(jié)果已在線發(fā)表于《自然通訊》雜志。

  自然界絕大部分植物都通過葉片的光合作用和根部的水分和營養(yǎng)吸收維持自養(yǎng)生存,而寄生植物則是一類通過寄生在自養(yǎng)植物上獲取能量和營養(yǎng)的植物。旋花科莖寄生植物菟絲子寄生行為在實驗室中方便控制和觀察,近年來已成為探索寄生植物生理生態(tài)和進化生物學的重要研究對象。

  為了解密菟絲子屬植物的演化,同時也為以菟絲子為模型的寄生植物生理生態(tài)研究提供重要資源和基礎(chǔ),中國科學院昆明植物研究所吳建強研究組利用純?nèi)鷾y序技術(shù),獲取了高質(zhì)量南方菟絲子參考基因組,他們結(jié)合基因系統(tǒng)發(fā)育分析與共線性分析,發(fā)現(xiàn)菟絲子屬與番薯屬植物的共同祖先在約750萬年前經(jīng)歷了一次全基因組三倍化加倍事件,神奇的是,隨后菟絲子又經(jīng)歷了快速進化以及大規(guī)模的基因丟失。他們發(fā)現(xiàn)自養(yǎng)植物中保守的基因約11.7%在菟絲子基因組中發(fā)生了丟失,而丟失基因大部分與光合作用、根和葉的功能與發(fā)育、植物抵御逆境與脅迫和基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控等相關(guān)。這些在自養(yǎng)植物中非常重要的基因在菟絲子中的丟失,很可能與它的根與葉片的退化相關(guān)。菟絲子的寄生習性,離不開特有器官吸器的演化。

  結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、基因選擇壓力分析和基因家族擴張分析,研究者還找到了一系列可能與吸器功能和發(fā)育相關(guān)的基因。研究人員通過比較基因組學、分子進化等獲得了大量信息,為了解寄生植物的演化、寄生植物與寄主間的相互作用提供了重要依據(jù)。

  《科技日報》(2018年7月12日 頭版)

  來源:http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2018-07/12/content_399061.htm?div=-1 


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