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　　記者從中科院昆明植物所獲悉，該所極小種群野生植物綜合保護(hù)團(tuán)隊(duì)完成了漾濞槭全基因組測序、組裝，獲得了近于染色體水平的高質(zhì)量全基因組，這也是目前首例槭樹科植物的全基因組報(bào)道，相關(guān)研究成果發(fā)表于Giga Science。

　　組裝完成的漾濞槭基因組大小約為666Mb，其Contig N50達(dá)到5.48Mb，Scaffold N50大小為44.92Mb；重復(fù)序列占比68.0%，28320個(gè)蛋白編碼基因得到了從頭或基于同源基因的功能注釋；通過BUSCO分析得到了95.5%的組裝完整性評(píng)估。

　　“通過與葡萄的全基因組共線性分析顯示，漾濞槭在核心雙子葉共有的一次古基因組六倍化事件后，沒有再經(jīng)歷過全基因組的重復(fù)事件；另外，與葡萄染色體相比，4、6和8號(hào)染色體未檢測到染色體間的插入或重排，說明漾濞槭染色體中保留了大量祖先染色體成分?！崩ッ髦参锼芯繂T馬永鵬說。

　　馬永鵬表示，鑒于漾濞槭高質(zhì)量的全基因組信息以及染色體進(jìn)化特征，其地位可以替代葡萄，成為無患子目染色體進(jìn)化分析最重要的參考基因組。

　　近年來隨著全基因組測序成本的降低，使得從全基因組層面通過揭示物種的種群歷史動(dòng)態(tài)、長期的適應(yīng)性演化與短期、尤其是近期的快速環(huán)境適應(yīng)等特征深度解析極小種群野生植物的瀕危機(jī)制成為可能。

　　據(jù)了解，漾濞槭是云南省20個(gè)優(yōu)先拯救保護(hù)的極小種群野生植物之一，隸屬于槭樹科的楓屬植物，該屬植物在產(chǎn)糖、用材和觀賞方面都具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。極小種群野生植物綜合保護(hù)團(tuán)隊(duì)針對(duì)漾濞槭已經(jīng)開展了十余年的研究工作，目前已經(jīng)明確了漾濞槭野外種群數(shù)量、傳粉生物學(xué)與種子散布特征以及物種的遺傳樣性與種群結(jié)構(gòu)。目前該團(tuán)隊(duì)已經(jīng)人工擴(kuò)繁數(shù)萬株漾濞槭種苗，將用于后續(xù)的種群回歸與復(fù)壯。

　　相關(guān)論文信息：

　　https://academic.oup.com/gigascience/article/8/7/giz085/5532406?searchresult=1 

　?。茖W(xué)網(wǎng) 2019年7月27日）

　　來源：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2019/7/428781.shtm