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【中國(guó)科學(xué)報(bào)】新研究解析栽培草莓“祖先”基因組圖譜 文章來(lái)源: | 發(fā)布時(shí)間:2023-08-28 | 作者: | 瀏覽次數(shù): | 【打印】 【關(guān)閉】 本報(bào)訊(記者高雅麗)草莓具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,現(xiàn)代八倍體栽培草莓起源于兩個(gè)八倍體野生種——弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日,中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所研究員朱安丹課題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關(guān)成果在線發(fā)表于《自然-植物》。 朱安丹表示,由于草莓屬系統(tǒng)發(fā)育解析涉及未知的祖先、同源染色體交換和不完全譜系分選等問題,八倍體草莓的二倍體祖先問題至今仍存在較大爭(zhēng)議。此外,八倍體草莓在馴化過程中的亞基因組的同源偏向性表達(dá)及轉(zhuǎn)變模式并不明確。 該研究提出了一套適用于多倍體的ALLHiC迭代掛載流程,構(gòu)建了兩個(gè)八倍體野生草莓——弗州草莓和智利草莓染色體水平的高質(zhì)量分型基因組。研究人員完成了八倍體草莓亞基因組的分離,并在此基礎(chǔ)上采用不同的分析方法重新追溯了八倍體草莓的二倍體祖先。 研究結(jié)果糾正了國(guó)外學(xué)者在亞基因組分配上的錯(cuò)誤,并進(jìn)一步確定森林草莓和飯沼草莓是八倍體草莓現(xiàn)存的二倍體祖先種。研究還探討了八倍體草莓在馴化過程中的同源偏向性表達(dá)分化,并基于空間四聯(lián)體方法完成了八倍體草莓的靜態(tài)和動(dòng)態(tài)的同源偏向性分析,并鑒定到一些重要的轉(zhuǎn)錄因子在馴化過程中發(fā)生了表達(dá)偏倚。 相關(guān)論文信息: https://doi.org/10.1038/s41477-023-01473-2 《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 (2023-08-28 第1版 要聞)
來(lái)源:https://news.sciencenet.cn/sbhtmlnews/2023/8/376001.shtm
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