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紅豆杉屬植物均為國家一級保護(hù)植物，紅豆杉屬植物的分類在中國－喜馬拉雅地區(qū)一直比較混亂，存在較大的爭議，認(rèn)為這一地區(qū)主要分布有須彌紅豆杉、歐洲紅豆杉（T. baccata L.）和密葉紅豆杉（T. fuana Nan Li & R.R. Mill），種間關(guān)系不明確，該地區(qū)紅豆杉的種級地位存在較大的爭議。中國科學(xué)院昆明植物研究所高連明博士在國家基金青年基金項目的資助下，對須彌紅豆杉的譜系地理學(xué)進(jìn)行了研究。主要研究進(jìn)展如下：

1. 項目組通過對須彌紅豆杉的生存狀況及資源現(xiàn)狀的深入調(diào)查，發(fā)現(xiàn)人為因素可能是導(dǎo)致該物種瀕危的主要原因；

2. 通過對須彌紅豆杉43個居群815個個體進(jìn)行了葉綠體trnL-F片段的測序與分析，共鑒定出29種葉綠體單倍型。譜系分析表明，須彌紅豆杉的單倍型具有顯著的生物地理結(jié)構(gòu)(NST = 0.768, GST = 0.469, P < 0.01)。Network分析表明，29個葉綠體單倍型形成了橫斷山區(qū)和東喜馬拉雅地區(qū)2個譜系，兩個譜系分化的時間約為3.41-7.61Ma，與青藏高原的快速隆升密切相關(guān)。對單倍型的失配分析表明，橫斷山地區(qū)分布的居群在末世冰期后經(jīng)歷過快速擴(kuò)張和奠基者效應(yīng)；而東喜馬拉雅地區(qū)分布的居群可能受第四紀(jì)的冰期和間冰的反復(fù)作用，經(jīng)歷過多次收縮和擴(kuò)張過程形成，可能存在多個不同的避難所；

3. 基于對須彌紅豆杉43個居群815個個體的9對SSR分子標(biāo)記的群體遺傳學(xué)分析表明，須彌紅豆杉在物種水平上具有較高的遺傳多樣性，居群間的遺傳分化明顯（Fst=0.217, p<0.001）。單倍型數(shù)據(jù)分析形成的橫斷山和東喜馬拉雅2個譜系得到了SSR數(shù)據(jù)的支持，怒山山脈形成了2個譜系的天然的屏障，阻礙了它們間的基因流。綜合本項目的結(jié)果，提出了就地保護(hù)應(yīng)該作為須彌紅豆杉的優(yōu)先保護(hù)策略，遷地保護(hù)可作為就地保護(hù)的有效補充。

該項目構(gòu)建了分布于歐亞地區(qū)紅豆杉屬植物的DNA條形碼物種鑒定數(shù)據(jù)庫，還篩選出了20對可用于須彌紅豆杉譜系地理學(xué)和保護(hù)遺傳學(xué)的SSR分子標(biāo)記，同時還首次利用分子生物學(xué)的方法證明了紅豆杉屬植物線粒體的遺傳方式不是母系遺傳而是父系遺傳的結(jié)論。同時，發(fā)表了4篇SCI論文，培養(yǎng)了2名博士研究生。

本項目2010年度已經(jīng)結(jié)題，在我所組織的國家基金項目結(jié)題驗收會中綜合評價為優(yōu)秀。