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科研進展

昆明植物所在竹類開花相關miRNA研究中取得新進展

文章來源:種質(zhì)資源庫  |  發(fā)布時間:2014-12-01  |  作者:王曉燕  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關閉

 

  miRNA(micoRNA)是一類長度為18-24nt的非編碼內(nèi)源小分子RNA,在植物中,miRNA通過RISC復合體實現(xiàn)對靶基因mRNA的翻譯抑制或降解,從而對植物的生命活動進行調(diào)控。植物的生長周期分為營養(yǎng)生長期和生殖生長期兩個階段,兩個時期的轉(zhuǎn)化是植物整個生命周期中極為關鍵的一環(huán),miRNA在其中發(fā)揮著巨大且不可替代的作用。 

  竹類植物開花一直是植物界的“難解之謎”。中國科學院昆明植物研究所郭振華研究組在對多年生零星開花的熱帶木本竹種麻竹(Dendrocalamus latiflorus)的開花習性進行多年觀察的基礎上,對其開花相關miRNA進行了系統(tǒng)深入的研究。研究通過Solexa深度測序技術(shù)構(gòu)建了兩個不同發(fā)育階段的麻竹花的sRNA序列文庫,并從中獲得了118個保守miRNA47個麻竹特有miRNA,在對這些miRNA的進一步分析中,發(fā)現(xiàn)15miRNA的功能是與花發(fā)育相關的。此外,我們也建立了麻竹花miRNA的靶基因數(shù)據(jù)庫,并通過5’RACE獲取了部分靶基因的剪切位點。本研究首次對竹亞科植物中花的miRNA進行了全面的分析,并對miRNA在竹子開花現(xiàn)象中的調(diào)控作用進行了初步探討,進一步闡明了竹子開花的內(nèi)在分子機制。 

  近日,該研究成果以“Investigating the MicroRNAomes of Two Developmental Phases of Dendrocalamus latiflorus (Poaceae: Bambusoideae) Inflorescences”為題發(fā)表于《植物分子生物學導報》(Plant Molecular Biology Reporter)上(http://link.springer.com/article/10.1007/s11105-014-0808-z),項目得到了國家自然科學基金和中國科學院“西部之光”人才培養(yǎng)計劃支持。

  圖1:a-d sRNA類型和數(shù)量在時期12中的分布總結(jié)。 

  a. Uniq-sRNAs的餅圖  b. Total-RNA的餅圖 

  c.在時期12uniqe sRNAs的分布(X軸表示RNA的分類,Y軸表示uniq-sRNA 的數(shù)量) 

  d.時期12total sRNAs的分布(X軸表示RNA的分類,Y軸表示total sRNA 的數(shù)量) 

  2:dla-miR396b前體在時期1中的比對 

 

 


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