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科研進展

昆明植物所李德銖研究組在竹類植物葉綠體基因組中發(fā)現(xiàn)水平基因轉(zhuǎn)移

文章來源:  |  發(fā)布時間:2015-06-26  |  作者:馬朋飛  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  水平基因轉(zhuǎn)移(horizontal gene transferHGT)是指不同物種間,或是同一物種內(nèi)不同細胞器間或細胞器與細胞核之間遺傳物質(zhì)橫向傳遞的過程。目前已知的水平基因轉(zhuǎn)移主要發(fā)生在原核生物以及單細胞真核生物中,對這些類群生物的進化起著十分重要的作用。近年來,越來越多的水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象在多細胞真核生物中被發(fā)現(xiàn),尤其是在被子植物不同細胞器之間,如線粒體(mitochondrion)基因組中常存在大量來自葉綠體(plastid)基因組的水平基因轉(zhuǎn)移。然而,被子植物葉綠體基因組在進化上十分保守,極少發(fā)現(xiàn)水平基因轉(zhuǎn)移,目前僅在兩種真雙子葉植物中有報道。 

  中國科學院昆明植物研究所李德銖研究組長期致力于竹類植物系統(tǒng)發(fā)育研究。近來,該研究組馬朋飛博士等科研人員完成了草本竹類Pariana3種植物的葉綠體基因組測序,發(fā)現(xiàn)其在結(jié)構(gòu)組成、基因含量等特征上與已知的竹類葉綠體基因組十分相似。然而,在該葉綠體基因組的反向序列重復(fù)區(qū)發(fā)現(xiàn)一段大小為~2.7 kb的外源DNA片段,并且通過測序深度分析、PCR克隆擴增等手段證實了拼接序列的可靠性。通過Blast比對分析發(fā)現(xiàn)這段外源插入序列與該組報道的鐵竹以及先前報道的綠竹線粒體基因組序列具有極高的相似性,推測其為線粒體DNA片段的水平轉(zhuǎn)移。這是第一例發(fā)現(xiàn)在單子葉葉綠體基因組中的水平基因轉(zhuǎn)移,進一步證實了被子植物葉綠體基因組中水平基因轉(zhuǎn)移的存在。該研究對于探討葉綠體基因組中水平基因轉(zhuǎn)移的機制以及在被子植物進化中所起的作用具有重要的意義。 

  該研究以“Evidence for horizontal transfer of mitochondrial DNA to the plastid genome in a bamboo genus”為題在線發(fā)表于國際期刊 Scientific Reports 上(http://www.nature.com/srep/2015/150623/srep11608/full/srep11608.html)。該研究得到了國家自然科學基金以及NSFC—云南省聯(lián)合基金項目(U1136603, 3117020431300184)的支持。 

竹類植物葉綠體基因組中水平轉(zhuǎn)移DNA片段的大小及位置

    


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