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　　豆科是被子植物第三大科，約有765屬19500種。豆科植物世界廣布，形態(tài)和生活型高度多樣。豆科的經(jīng)濟(jì)價值僅次于禾本科，但豆類植物是人類最重要的植物蛋白質(zhì)來源，在某些貧困地區(qū)甚至是唯一的蛋白質(zhì)來源。豆科植物中約88%的種具有根瘤固氮功能，為農(nóng)業(yè)和自然生態(tài)系統(tǒng)提供了重要生物氮。“綠肥”的使用對減少化肥特別是氮肥的使用，改良土壤生態(tài)系統(tǒng)具有重要意義。 

　　傳統(tǒng)上豆科被劃分為三亞科，即云實亞科（蘇木亞科），含羞草亞科和蝶形花亞科乃至三個獨立的科，并被廣泛接受和認(rèn)可。國內(nèi)外幾乎所有的標(biāo)本館、植物志、野外采集手冊和文獻(xiàn)中，豆科都按照三個亞科（或科）的分類系統(tǒng)來劃分的。近年來，分子系統(tǒng)學(xué)的研究發(fā)現(xiàn)云實亞科為并系類群，含羞草亞科和蝶形花亞科作為單系分支嵌套在其中，傳統(tǒng)的三個亞科的分類系統(tǒng)受到了質(zhì)疑。中國科學(xué)院昆明植物研究所伊廷雙研究員作為成員參加的國際豆科系統(tǒng)發(fā)育工作組（Legume Phylogeny Working Group，即LPWG）基于葉綠體matK序列數(shù)據(jù)，構(gòu)建了一棵迄今為止取樣最全（約91%的屬和20%的種）的豆科系統(tǒng)發(fā)育樹，并結(jié)合形態(tài)證據(jù)，提出了六個亞科的新分類系統(tǒng)。該分類系統(tǒng)中，僅原蝶形花亞科PapilionoideaeDC.被保留；原含羞草亞科不復(fù)存在，而成為新云實亞科Caesalpinioideae DC.一個分支mimosoid clade；除保留在新云實亞科中的類群，原云實亞科其余四個分支新擬為四個亞科：即紫荊亞科Cercidoideae LPWG (stat. nov.)、甘豆亞科Detarioideae Burmeist.、酸欖豆亞科Dialioideae LPWG (stat. nov.)和山姜豆亞科Duparquetioideae LPWG (stat. nov.)。新的分類系統(tǒng)對豆科分類學(xué)、基因組學(xué)、發(fā)育生物學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)研究將會產(chǎn)生重要影響。該研究以“A new subfamily classification of the Leguminosae based on a taxonomically comprehensive phylogeny”為題發(fā)表在Taxon上（http://chinesesites.library.ingentaconnect.com/contentone/iapt/tax/2017/00000066/00000001/art00004）。 

　　豆科是被子植物葉綠體基因組經(jīng)歷重大結(jié)構(gòu)變化的幾個分支之一。先前的研究由于取樣有限，一般認(rèn)為結(jié)構(gòu)變化主要發(fā)生在原蝶形花亞科中，原云實亞科和含羞草亞科的葉綠體基因組和大多數(shù)其它被子植物一樣具有保守的結(jié)構(gòu)。然而，近來有研究發(fā)現(xiàn)原含羞草亞科的一些種也存在葉綠體結(jié)構(gòu)變異。近期，中國科學(xué)院昆明植物研究所中國西南野生生物種質(zhì)資源庫伊廷雙研究組與李德銖研究組和王紅研究組合作，對原含羞草亞科三個族14屬14種的葉綠體進(jìn)行了深入的研究，結(jié)果表明：1）先前被報道的反轉(zhuǎn)重復(fù)序列（IR）往小單拷貝區(qū)（SSC）13 kb的擴(kuò)張廣泛存在印加族和狹義金合歡屬，并且是這兩個類群構(gòu)成的分支的共衍征；2）一些種的IR在大單拷貝區(qū)（LSC）一端經(jīng)歷了擴(kuò)張和收縮，clpP基因發(fā)生了復(fù)制和內(nèi)含子的丟失以及rps18基因發(fā)生了反轉(zhuǎn)等；3）基因從單拷貝區(qū)轉(zhuǎn)移到IR區(qū)后，替換速率顯著下降。此外，還發(fā)現(xiàn)含羞草分支區(qū)段的序列分化有很大的差異，葉綠體基因組能有效解決含羞草分支的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。該研究為進(jìn)一步研究含羞草分支乃至整個豆科系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)提供了重要基礎(chǔ)。研究結(jié)果以“Plastomes of Mimosoideae: structural and size variation, sequence divergence, and phylogenetic implication”為題發(fā)表在Tree Genetics & Genomes上（http://link.springer.com/article/10.1007/s11295-017-1124-1）。研究得到了國家科技部基礎(chǔ)研究專項（No. 2013FY112600）、國家重大科學(xué)研究計劃項目（2014CB954100）和云南省人才項目（No. 2011CI042）的資助。 

圖1、豆科六個亞科分類系統(tǒng)框架圖 

　　圖2、含羞草分支葉綠體基因組反轉(zhuǎn)重復(fù)序列（IR）的擴(kuò)張/收縮