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　　長鏈非編碼RNA（lncRNAs）是基因組轉(zhuǎn)錄水平的重要形式之一，但長期以來lncRNAs的生物學(xué)意義一直缺乏認識。越來越多的研究發(fā)現(xiàn)植物lncRNAs可能廣泛參與調(diào)控植物生長發(fā)育以及對環(huán)境脅迫的反應(yīng)。在開花植物種子發(fā)育過程中由于雙受精現(xiàn)象的發(fā)生產(chǎn)生了2倍體的胚和3倍體的胚乳。可能是因為胚乳具有不均等的父母本基因組劑量，引起了豐富的表觀修飾如胚乳基因組的低甲基化和基因印跡（gene imprinting），但長期以來lncRNAs在胚和胚乳中的表達式樣及其是否參與種子發(fā)育過程中的表觀調(diào)控還不清楚。對于大部分雙子葉植物（如擬南芥）而言，在種子發(fā)育過程中，胚乳會隨著種子的發(fā)育而消失，從而給調(diào)查胚乳的表觀調(diào)控帶來困難。 

　　劉愛忠團隊研究利用雙子葉典型的胚乳型種子植物蓖麻為研究材料，深入解析了lncRNAs的表達規(guī)律，揭示了lncRNAs與其臨近的蛋白編碼基因表現(xiàn)了強烈的共表達，而且它們參與了不同的表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，強烈地暗示了lncRNAs在調(diào)控胚和胚乳的發(fā)育中發(fā)揮著重要的生物學(xué)功能。同時，通過比較發(fā)現(xiàn)lncRNAs在物種間的序列保守性低，而在基因組上的位置保守性高。結(jié)合前期蓖麻種子DNA 甲基化分析的結(jié)果（Xu et al., 2016, Plant Physiology），研究發(fā)現(xiàn)胚乳特異表達的lncRNAs與胚乳基因組的低甲基化密切相關(guān)。在互交胚和胚乳中（ZB107 × ZB306），絕大部分等位基因能夠按照它們父母本基因組的劑量進行表達，顯示出lncRNAs對父母本基因組劑量的改變不敏感（從胚的1m：1p到胚乳的2m：1p）。但在胚乳中，有lncRNAs等位位點的表達顯著偏離了父母本基因組比例2m：1p的現(xiàn)象，表現(xiàn)出明顯的父母本起源影響（parent-of-origin effect），即基因組印跡；一些印跡的lncRNAs與先前鑒定的印跡基因（Xu et al., 2014, Nucleic Acids Research）在基因組中顯著聚類，且表現(xiàn)出協(xié)同轉(zhuǎn)錄，進一步強烈暗示了lncRNAs可能參與了基因組印跡的發(fā)生。 

　　文章鏈接 

　　圖(a)：胚乳基因組低甲基化對lncRNAs表達的影響；(b)：等位lncRNAs的遺傳表達模式；(c)：印跡lncRNA與印跡基因的協(xié)同表達和共聚類。 

　　（責任編輯：李雪）